Oligonukleotide

Oligonukleotide (von ) sind aus wenigen Nukleotiden (DNA oder RNA) aufgebaute Oligomere (mit Suffix -mer von gr. meros ‚Teil‘, ‚Gebiet‘). Man spricht daher beispielsweise bei 25 Nukleotidsequenzen (nt) von einem 25-mer. Ein weiteres Beispiel: Die Haarnadelstruktur des Genoms der Viren des Phylums Cressdnaviricota (englisch ) enthält ein hochkonserviertes Nonanukleotid (9 nt).

Für viele der Anwendungen besteht die Nukleotidsequenz zwischen 15 und 30 Nukleotideinheiten (entsprechend einem 15-mer bis 30-mer).

Eingesetzt werden Oligonukleotide als

• Primer für die Polymerase-Kettenreaktion (PCR)
• Sonden bei der Real Time Quantitative PCR
• Primer für die DNA-Sequenzierung
• Primer für die cDNA-Synthese
• Primer für das Random Priming
• Bausteine für das Vectordesign
• Bausteine für die künstliche Gensynthese
• Antisense-Oligonukleotide
• Oligonukleotid DNA-Fingerprinting
• Oligonukleotidsonde
• Oligonukleotid-Chip
• Mutagenese-Kassette oder Primer in der Oligonukleotidvermittelten Mutagenese ()<ref>Laborjournal: Zielgerichtete Mutagenese, Teil I. Abgerufen am 15. September 2020. , Teil II. Abgerufen am 15. September 2020. , Teil III. Abgerufen am 15. September 2020. </ref>
• Electrophoretic Mobility Shift Assay (EMSA)

Aptamere (von ) sind Oligonukleotide, die ein spezifisches Molekül über ihre 3D-Struktur binden können. Verschiedene Oligonukleotide werden als Arzneistoffe verwendet.<ref>M. Egli, M. Manoharan: Chemistry, structure and function of approved oligonucleotide therapeutics. In: Nucleic acids research. Band 51, Nummer 6, April 2023, S. 2529–2573, doi:10.1093/nar/gkad067, PMID 36881759, PMC 1008571 (freier Volltext).</ref>

Synthese

Die Oligonukleotide werden nach der Phosphoramidit-Methode an fester Phase (Festphasensynthese) synthetisiert. Bei der Synthese besteht die Möglichkeit Modifizierungen wie Fluoreszenzmarkierungen einzubauen.

Siehe auch

• Polynukleotid

Einzelnachweise

<references />