Thermoplasmata

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Datei:Hallan-en-un-microorganismo-primitivo-una-proteina-capaz-de-reparar-ADN.jpg

Ferroplasma acidiphilum

Thermoplasmata ist die Bezeichnung einer Klasse von Archaeen in der Reich Methanobacteriati (früher Euryarchaeota s. l. oder Euryarchaeida).<ref name="NCBI"/><ref name="LPSN"/> Die Zuordnung zu einem Phylum (Abteilung) innerhalb der Methanobacteriati wird noch diskutiert (Stand 1. September 2025), in der {{#invoke:Vorlage:lang|flat}} (LPSN) gehören die Thermoplasmata zum Phylum Methanobacteriota,<ref name="LPSN"/> in der {{#invoke:Vorlage:lang|flat}} (GTDB) und der Taxonomie des {{#invoke:Vorlage:lang|flat}} (NCBI) werden sie unter der gemeinsamen Bezeichnung Thermoplasmatota zu den Klassen des LPSN-Phylums Poseidoniota an die Seite gestellt.<ref name="NCBI"/><ref name="GTDB"/>

Die Thermoplasmata sind fakultativ anaerob, d. h. sie können sowohl in Gegenwart als auch in Abwesenheit von freiem Sauerstoff leben. Sie typischerweise thermoacidophil, d. h. sie benötigen meist hohe Temperaturen und einen niedrigen pH-Wert (acidophil = säureliebend).

Die meisten Mitglieder der Thermoplasmata sind thermophil. Als acidophile Organismen wachsen die Thermoplasmata optimal bei einem pH-Wert unter 2.<ref name="Schleper1994"/> Es gibt jedoch auch einige nicht kultivierte Thermoplasmata-Mitglieder, die unter gemäßigten Bedingungen an der Meeresoberfläche und am Meeresboden leben.<ref name="Reysenbach2001"/><ref name="Rosenberg2014"/><ref name="Cracraft2004"/>

Zusammen mit einigen nahe verwandten Gruppen, insbesondere der Klasse Poseidoniia, bilden die Thermoplasmata eine Klade, die teilweise als Phylum Thermoplasmatota<ref name="LPSN_Phylum"/><ref name="NCBI_Phylum"/><ref name="GTDB_Phylum"/> innerhalb des Reichs Methanobacteriati (früher Superphylum Euryarchaeida oder Euryarchaeota sensu lato) angesehen wird.

Andere Taxonomien sehen die Thermoplasmata als Mitglied der Methanobacteriota (früher Phylum Euryarchaeota sensu stricto). Die Klasse Poseidoniia bildet mit einigen verwandten Gruppen dort das Phylum Poseidoniota.<ref name="LPSN"/>

Thermoplasmatales

Die Mitglieder der Ordnung Thermoplasmatales sind alle acidophil (säureliebend) und wachsen optimal bei pH-Werten unter 2.

Die Archaeen der Gattung Thermoplasma leben beispielsweise in Halden von Kohleschlacken, wo chemoautotrophe Bakterien Eisenpyrit zu Schwefliger Säure und Schwefelsäure oxidieren. Dies führt zu hohen Temperaturen und einem niedrigen pH-Wert, was die Bildung kleiner Kohlenstoffmoleküle begünstigt, die von diesen Organismen verstoffwechselt werden können.

Die dieser Ordnung zugehörige Gattung Picrophilus war zur Zeit ihrer Erstbeschreibung 1996 der acidophilste aller bekannten Organismen, sie wächst bei einem pH-Wert von 0,06 oder weniger.<ref name="Schleper1994"/> Die Thermoplasmata haben meist keine Zellwand. Picrophilus ist hierbei eine Ausnahme, ihre Zellmembran besteht aus großen Mengen von Lipopolysacchariden und Glykoproteinen, die sie vor Hitze und Säuren schützen.<ref name="Schleper1994"/>

{{#invoke: Vorlage:Anker|f |errCat=Wikipedia:Vorlagenfehler/Vorlage:Anker |errHide=1}}„Ca. Lutacidiplasmatales“

Die ersten Hinweise auf die ursprünglich so genannte {{#invoke:Vorlage:lang|flat}} (TMEG), heute per Vorschlag „Ca. Lutacidiplasmatales“, fanden sich durch Metagenomik-Analysen von Proben aus südafrikanischen Goldminen. Weitere Analysen lieferten den Nachweis, dass sie eine eigenständige taxonomische Klade bilden.<ref name="Sheridan2022"/> Auf der Grundlage des Genoms ihres Vertreters TMEG-bg1 aus tiefen anaeroben Torfschichten ließen sich Vorhersagen über ihren Stoffwechsel treffen.<ref name="Sheridan2022"/> Demnach kann TMEG-bg1 Fettsäuren durch anaerobe Atmung oder durch syntrophische Wechselwirkungen mit Methanogenen oxidieren.<ref name="Lin2015"/>

Im Jahr 2022 beschrieben Sheridan et al. die Gruppe als Kandidaten-Ordnung „Ca. Lutacidiplasmatales“, wobei die Teile „Luti“ und „acidi“ auf die Häufigkeit in saurem Boden und „plasma“ auf die Verwandtschaft mit den Thermoplasmata (bzw. Thermoplasmatota) hinweisen.<ref name="Sheridan2022"/>

{{#invoke: Vorlage:Anker|f |errCat=Wikipedia:Vorlagenfehler/Vorlage:Anker |errHide=1}}„Ca. Yaplasmales“

Ebenfalls im Jahr 2022 identifizierten Zhang et al. die Gruppe „Ca. Yaplasmales“ als weitere Kandidaten-Ordnung in dieser Verwandtschaft.<ref name="Zheng2022"/>

Methanomassiliicoccales

Eine weitere Ordnung der Thermoplasmata ist Methanomassiliicoccales, deren Mitglieder an der Methanogenese beteiligt sind.

Habitat

Die Thermoplasmata kommen in zahlreichen Nischen und Umgebungen vor, die ersten identifizierten Vertreter fanden sich in südafrikanischen Goldminen, die „Ca. Lutacidiplasmatales“ umfassen häufig vorkommende Arten auf dem Festland.<ref name="Sheridan2022"/>

Es wird angenommen, dass ihr (letzter) gemeinsamer Vorfahr auch schon thermophil war, und dass mehrere Arten erst später und unabhängig voneinander, d. h. im Zug zunehmender Diversität mesophil wurden. Aufgrund der Genome von „Ca. Lutacidiplasmatales“ sind aerobe Atmung, Glykolyse und Säuretoleranz in dieser Ordnung vermutlich wiederholt durch konvergente Evolution und horizontalen Gentransfer (HGT) entstanden.<ref name="Sheridan2022"/> Andererseits entstanden auch polyextremophile Arten, mit Habitaten wie beispielsweise dem Großen Salzsee ({{#invoke:Vorlage:lang|flat}}, GSL) in den USA<ref name="Shoemaker2024"/> oder den Natriumchloridseen der Kulundasteppe – wie z. B. T1Sed10_119m (Thermoplasmata PWHR01)<ref name="NCBI_T1Sed10_119m"/> bei {{#invoke:Vorlage:lang|flat}}<ref name="Malinowoje">Malinowoje Osero, Google Maps; Malinovoye Ozero, GeoNames.</ref> und CSSed10_214 (Thermoplasmata PWKY01)<ref name="NCBI_CSSed10_214"/> im Kleinen {{#invoke:Vorlage:lang|flat}} südöstlich von {{#invoke:Vorlage:lang|flat}} (Russland), an der Grenze zu Kasachstan.<ref name="Petukhovo">Ozero Petukhovo, GeoNames</ref>

{{#invoke:Vorlage:Anker|f |errCat=Wikipedia:Vorlagenfehler/Vorlage:Anker |errHide=1}}Lebensweise und Stoffwechsel

Die Thermoplasmata verfügen über eine säuretolerante V/A-ATPase (A-Typ/V-Typ).<ref name="Sheridan2022"/> Zu Beginn ihrer Evolution stieg der GC-Gehalt der Lutacidiplasmatales, Methanomassiliicoccales, Gimiplasmatales und Lunaplasmatales sowie der Ordnung SG8-5 an.<ref name="Sheridan2022"/>

Die Thermoplasmata sind zur aeroben Zellatmung fähig, es gibt strikt aerobe und fakultativ anaerobe Arten. Auf Basis der Sequenz von TMEG-bg1 (2022) wird angenommen, dass es mehrere anaeroben Arten gibt, die langkettige Fettsäuren und Sulfite abbauen und dabei Schwefelwasserstoff (H₂S) produzieren.<ref name="Sheridan2022"/>

Mitglieder von „Ca. Angelarchaeales“ verfügen über einen Dehydrogenase-Komplex für verzweigtkettige Ketosäuren ({{#invoke:Vorlage:lang|flat}}, BCKDH), der die Spaltung von verzweigtkettigen Aminosäuren zu Acetyl- und Propionyl-CoA ermöglicht (der erste Weg wird auch von einem Glyoxylat-Enzym genutzt).<ref name="Diamond2022"/>

Vertreter der Ordnung „Ca. Yaplasmales“ sind am Kreislauf organischer Verbindungen in Tiefseesedimenten beteiligt und bauen Alkane mit einer Alkylsuccinat-Synthase ab. Von den drei Kladen A, B und C (den GTDB-Familien f__JAGMCJ01, f__JAJISG01 respektive f__RBG-16-68-12, s. u.) ist die Klade A basierend auf ihrem vollständigen Wood-Ljungdahl-Stoffwechselweg und ihren vermutlichen Genen für den Abbau von aromatischen und organischen Halogenverbindungen vermutlich mixotroph: Die Kladen B und C sind dagegen wahrscheinlich heterotroph, wobei sie Spermidin, Putrescin und aromatische Verbindungen abbauen können.<ref name="Zheng2022"/>

Bedeutung für den Menschen

Arten der Methanomassiliicoccaceae zählen zu den häufigsten Vertretern im Verdauungstrakt, daneben kommen dort auch Arten der Methanomethylophilaceae vor. Diese beiden Gruppen treten dabei selten gemeinsam auf.<ref name="Candeliere2024"/>

Systematik

Vorlage:Annotiertes Bild

Die genaue Taxonomie dieser Klasse ist noch in der Diskussion (Stand September 2025).

Die Ordnung „Ca. Aciduliprofundales“<ref name="LPSN_Aciduliprofundales"/> [DVHE2 group]<ref name="NCBI_DVHE2"/> ist nach der NCBI-Taxonomie Mitglied des dortigen Phylums Thermoplasmatota, gehört aber nach der LPSN und der GTDB direkt zur Klasse Thermoplasmata.<ref name="GTDB"/><ref name="LPSN_Aciduliprofundales"/><ref name="NCBI_DVHE2"/>

Die (in der LPSN mit Stand 24. August 2025 nicht gelistete) Ordnung „Ca. Lutacidiplasmatales“ gilt in diesen Taxonomien, darunter NCBI und Sheridan et al. (2022), als Mitglied des dortigen Phylums Thermoplasmatota.<ref name="NCBI_Phylum"/><ref name="Sheridan2022"/> Ihr Mitglied UBA184<ref name="Sheridan2022"/> residiert in der GTDB ebenfalls dort, und zwar in der GTDB-Ordnung o__UBA184 der Klasse Thermoplasmata. Dies impliziert, dass die GTDB-Ordnung o__UBA184 ein Synonym für „Ca. Lutacidiplasmatales“ ist.<ref name="GTDB_UBA184"/> UBA184 residiert auch in der NCBI-Taxonomie in der Klasse Thermoplasmata (allerdings dort ohne Ordnungszuweisung).<ref name="NCBI_UBA184"/> Der nahe verwandte Stamm AcS1-36<ref name="Sheridan2022"/> findet sich in derselben GTDB-Gattung. „Ca. Lutacidiplasmatales“ [o__UBA184] ist somit ein Mitglied der Klasse Thermoplasmata. Eine verwandte Klade (Ordnung) ist:<ref name="Sheridan2022"/>

Stamm SubAcS15-131, Ordnung Lunaplasmatales; gemäß NCBI ist der Stamm Mitglied der Klasse Thermoplasmata.<ref name="GTDB_SubAcS15-131"/><ref name="NCBI_SubAcS15-131"/><ref name="Zinke2021"/> Diese Klade aus nur aus einer einzigen Spezies „Ca. Lunaplasma lacustris“ sollte nach Diamond et al. (2022) lediglich eine Familie innerhalb der von ihnen vorgeschlagenen Ordnung „Ca. Angelarchaeales“ darstellen (s. u.).<ref name="Diamond2022"/>

Die (in der LPSN mit Stand 24. August 2025 verwaiste<ref name="LPSN_Yaplasmales"/>) Ordnung „Ca. Yaplasmales“ (früher als Klade RBG-16-68-12 bezeichnet) gilt nach Zheng et al. (2022) ebenfalls als Mitglied des Phylums Thermoplasmatota.<ref name="Zheng2022"/> Ihr Mitglied, Archaeon bin162<ref name="Zheng2022"/> residiert in der GTDB ebenfalls dort, und zwar in der GTDB-Ordnung o__RBG-16-68-12 der Klasse Thermoplasmata.<ref name="GTDB_bin162_archaeon"/> Verwandte Kladen (Ordnungen) sind nach Zheng et al. (2022):<ref name="Zheng2022"/>

Stamm UBA10834, residiert in der GTDB in der GTDB-Ordnung o__UBA10834 [„Ca. Gimiplasmatales“, Diamond et al. (2022)<ref name="Diamond2022"/>] innerhalb der Thermoplasmata.<ref name="GTDB_UBA10834"/> Dieser und der Stamm RBG_19FT_COMBO_56_21 (GTDB-Spezies COMBO-56-21 sp001800815, GCA_001800815.1) residieren in der GTDB-Familie f__UBA10834. Zu dieser Ordnung gehört nach Hu et al. auch die Spezies „Ca. Gimiplasma haoranii“. Wegen vorausgesetzter Monophylie der vorgeschlagenen Taxa müssen daher „Ca. Gimiplasmataceae“ und f__UBA10834 synonym sein.<ref name="Hu2020"/>
Stamm SG8-5, residiert in der GTDB in der GTDB-Ordnung o__SG8-5 [„Ca. Proteinoplasmatales“, NCBI] innerhalb der Thermoplasmata<ref name="GTDB_SG8-5"/><ref name="NCBI_SG8-5"/>
„Ca. Angelarchaeales“, nahe verwandt mit Klade SG8-5, etwas weiter mit Klade UBA10834 und Methanomassiliicoccales [Methanomassillicoccales], enthält die Familie um „Ca. Lunaplasma lacustris“ SubAcS15-131.<ref name="Diamond2022"/><ref name="LPSN_Methanomassiliicoccales"/><ref name="NCBI_Methanomassiliicoccales"/>

Als Mitglieder der Klasse Thermoplasmata gehören diese Beispiele in einer Taxonomie mit Phylum „Ca. Poseidoniota“ mit der Klasse dem Phylum Methanobacteriota an.

Liste

Die folgende Systematik hat den Stand 8. September 2025:

Klasse Thermoplasmata <templatestyles src="Person/styles.css" />{{#if:|{{{4}}} |}}{{#if:|{{{2}}} |}}{{#if:| {{{3}}} |}}{{#if:| „{{{6}}}“ |}}Reysenbach{{#if:| {{{5}}}|}} 2002^(L,N,G)
Klasse[„Thermoplasmatia“ <templatestyles src="Person/styles.css" />{{#if:|{{{4}}} |}}{{#if:|{{{2}}} |}}{{#if:| {{{3}}} |}}{{#if:| „{{{6}}}“ |}}Oren, Parte & Garrity{{#if:| {{{5}}}|}} 2016,
Klasse „Thermoplasmia“ <templatestyles src="Person/styles.css" />{{#if:|{{{4}}} |}}{{#if:|{{{2}}} |}}{{#if:| {{{3}}} |}}{{#if:| „{{{6}}}“ |}}Cavalier-Smith{{#if:| {{{5}}}|}} 2020,
Klasse Picrophilea <templatestyles src="Person/styles.css" />{{#if:|{{{4}}} |}}{{#if:|{{{2}}} |}}{{#if:| {{{3}}} |}}{{#if:| „{{{6}}}“ |}}Cavalier-Smith{{#if:| {{{5}}}|}} 2002^(L)]

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Ordnung Thermoplasmatales <templatestyles src="Person/styles.css" />{{#if:|{{{4}}} |}}{{#if:|{{{2}}} |}}{{#if:| {{{3}}} |}}{{#if:| „{{{6}}}“ |}}Reysenbach{{#if:| {{{5}}}|}} 2002^(L,N,G)

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Vorlage:Klappbox

Es bedeuten:

L – {{#invoke:Vorlage:lang|flat}} (LPSN)<ref name="LPSN_Phylum"/><ref name="LPSN"/>
N – {{#invoke:Vorlage:lang|flat}} (NCBI) - Taxonomy Browser<ref name="NCBI_Phylum"/><ref name="NCBI"/>
G – {{#invoke:Vorlage:lang|flat}} (GTDB)<ref name="GTDB"/>, G* – frühere GTDB-Beziehung
D – Spencer Diamond et al. (2022)<ref name="Diamond2022"/>
H – Wenzhe Hu et al. (2020/2021)<ref name="Hu2020"/>
S – Paul O. Sheridan et al. (2022)<ref name="Sheridan2022"/>
Z – Heng Zhou et al. (2022)<ref name="Zhou2022"/>

Anm.: Der erstgenannte „Stamm“ (bzw. DNA-Sequenz, MAG) ist die Referenz.

Die Ordnung o__DTKX01 der GTDB wurde in eine eigene Schwester-Klasse c__DTKX01 verschoben (siehe Thermoplasmatota).<ref name="GTDB"/>

Phylogenie

Phylogenetischer Baum der Thermoplasmata nach zwei Vorschlägen:

16S-rRNA-basiert LTP 06_2022<ref name="LTP"/>
Vorlage:Klade

Basierend auf 53 Markerproteinen GTDB 09-RS220<ref name="GTDB_Phylo"/>

{{#if:| {{#if:| {{#if:| {{#if:| {{#if:| {{#if:| {{#if:| {{#if:| {{#if:| {{#if:| {{#if:| {{#if:| {{#if:| {{#if:| {{#if:| {{#if:| {{#if:| {{#if:| {{#if:| {{#if:| {{#if:| {{#if:|

{{#if:\| {{{label1}}} \| }}	left\|Vorlage:Klade\|2}}\|{	padding-left:0.5em;}}" \| Vorlage:Klade
	left\|Vorlage:Klade\|2}}\|{
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Etymologie

Die folgenden Herleitungen stammen, wo nicht anders angegeben, aus der LPSN zum jeweiligen Taxon (ausgehend von Thermoplasmata):<ref name="LPSN"/>

Die Bezeichnung der Typusgattung Thermoplasma leitet sich ab von Vorlage:GrcS und {{#invoke:Vorlage:lang|flat}}, ‚etwas Geformtes‘, es wird damit also eine heiße oder Hitze liebende formbare Masse bezeichnet, was – wie bei den meisten anderen Vertretern der Thermoplasmatota – auf das Fehlen einer Zellwand hinweist.
- Die Bezeichnung der Klasse Thermoplasmata leitet sich ab von der Typusgattung Thermoplasma, zusammen mit der Klassen kennzeichnenden Endung ‚-ata‘ (Nominativ Plural).
- Die Bezeichnung des Phylums Thermoplasmatota leitet sich ab von der Typusklasse Thermoplasmata, zusammen mit der Phyla kennzeichnenden Endung ‚-ota‘.
- Analog leitet sich die Bezeichnung der Ordnung Thermoplasmatales ebenfalls ab von der Typusklasse, aber mit der Ordnungen kennzeichnenden Endung ‚-ales‘.
Die Bezeichnung der Klasse Poseidoniia leitet sich ab von der Typusgattung Poseidonia, diese ist benannt nach Poseidon, dem griechischen Gott des Meeres; Poseidoniia („die Poseidonier“) bezeichnet also die Poseidonia-Klasse.
Die Bezeichnung der Ordnung Ca. Aciduliprofundales leitet sich her von ihrer Typusgattung Aciduliprofundum, diese setzt sich zusammen aus {{#invoke:Vorlage:lang|full|CODE=la |SCRIPTING=Latn |SERVICE=lateinisch}} und {{#invoke:Vorlage:lang|flat}}, angehängt ist der Suffix ‚-ales‘ für Ordnungen. Dies bezeichnet daher einen säureliebenden Organismus aus der Tiefe.
Die Bezeichnung der Ordnung Ca. Gimiplasmatales leitet sich ab von ihrer Typusgattung Gimiplasma, was sich zusammensetzt aus der Abkürzung GIM für das Guangdong {{#invoke:Vorlage:lang|flat}} und der Endung ‚-plasma‘ für eine formbare Masse; angehängt ist der Suffix ‚-ales‘ für Ordnungen.
Die Bezeichnung der Ordnung Ca. Halarchaeoplasmatales leitet sich ab von der Typusgattung Halarchaeoplasma, zusammengesetzt aus altgriechisch {{#invoke:Vorlage:lang|flat}}, Genitiv {{#invoke:Vorlage:lang|flat}}, dem Mittelteil ‚-archaeo-‘ zur Unterscheidung von Bakterien in ähnlichen Umgebungen, und der Endung ‚-plasma‘ für eine formbare Masse; angehängt ist der Suffix ‚-ales‘ für Ordnungen.
Die Bezeichnung der Ordnung (bzw. herabgestuft Familie) Ca. Lunaplasmatales leitet sich ab von ihrer Typusgattung Lunaplasma, diese ist zusammengesetzt aus lateinisch {{#invoke:Vorlage:lang|flat}} und der Endung ‚-plasma‘ für eine formbare Masse; angehängt ist der Suffix ‚-ales‘ für Ordnungen.
Die Bezeichnung der Ordnung Methanomassiliicoccales leitet sich ab von der Typusgattung Methanomassiliicoccus, zusammengesetzt aus den Namensteilen lateinisch ‚Methano-‘, Methan betreffend, ebenfalls lateinisch {{#invoke:Vorlage:lang|flat}} und neulateinisch {{#invoke:Vorlage:lang|flat}} von altgriechisch {{#invoke:Vorlage:lang|flat}}; die Ordnung ist noch mit dem Ordnungs-Suffix ‚-ales‘ versehen. Die Bezeichnung steht also für methanbildende Kügelchen aus (gefunden oder erforscht in) Marseille.
Die Bezeichnung der Ordnung Ca. Sysuiplasmatales leitet sich ab von ihrer Typusgattung Sysuiplasma, deren Name kommt vom Akronym SYSU der Sun-Yat-sen-Universität (Guangzhou), wo diese Organismen erforscht wurden, und der Endung ‚-plasma‘ für eine formbare Masse; die Ordnung ist noch versehen mit dem entsprechenden Suffix ‚-ales‘.<ref name="Yuan2021"/>
Die Bezeichnung der vorgeschlagenen Ordnung Ca. Yaplasmales leitet sich ab von {{#invoke:Vorlage:lang|full|CODE=zh|SCRIPTING=Hant|SERVICE=chinesisch}}, ‚-plasma-‘ für eine formbare Masse und dem Ordnungs-Suffix ‚-ales‘. Dies weist darauf hin, dass sie (unter anderem) in den nährstoffarmen Sedimenten der Tiefsee leben.<ref name="Zheng2022"/>

Eine provisorische Bezeichnung für eine Reihe von Euryarchaeota-Kladen aus Tiefsee-Hydrothermalquell ist DHVE oder DHVEG, ausgeschrieben {{#invoke:Vorlage:lang|flat}}, gefolgt von einer Nummer.

Weiterführende Literatur

Wissenschaftliche Journale

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Anna N. Rasmussen, Bradley B. Tolar, John R. Bargar, Kristin Boye, Christopher A. Francis: Diverse and unconventional methanogens, methanotrophs, and methylotrophs in metagenome-assembled genomes from subsurface sediments of the Slate River floodplain, Crested Butte, CO, USA. In: mSystems, Band 9, Nr. 7, Topic: Genomics and Proteomics, 23. Juli 2024, S. e0031424; {{#invoke:Vorlage:Handle|f|scheme=doi|class=plainlinks|parProblem=Problem|errCat=Wikipedia:Vorlagenfehler/Parameter:DOI|errClasses=error editoronly|errHide=1|errNS=0 4 10 100}}, }} PMC 11264602 (freier Volltext{{#if:|, PDF}}), PMID 38940520, Epub 28. Juni 2024 ({{#invoke:Vorlage:lang|full|CODE=en|SCRIPTING=Latn|SERVICE=englisch}}).

Wissenschaftliche Bücher

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{{#invoke:Vorlage:Anker|f |errCat=Wikipedia:Vorlagenfehler/Vorlage:Anker |errHide=1}}Datenbanken für wissenschaftliche Literatur

Weblinks

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Vorlage:Wikidata-Registrierung

Seiten zu Thermoplasmata auf MicrobeWiki, Kenyon College, Department of Biology
Thermoplamatota (Diaforarchaea group), auf Lifemap (cnrs.fr).

Einzelnachweise

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</ref> <ref name="LTP"> Vorlage:Lang (LTP_06_2022).

</ref> <ref name="Angelo"> Angelo Coast Range Reserve, University of California Natural Reserve System. </ref> <ref name="Adam2017"> Panagiotis S. Adam, Guillaume Borrel, Céline Brochier-Armanet, Simonetta Gribaldo: The growing tree of Archaea: new perspectives on their diversity, evolution and ecology. In: The ISME Journal, Band 12, Nr. 11, 4. August 2017, S. 2407–2425; Vorlage:Doi, Vorlage:PMC, PMID 28777382 (Vorlage:EnS). </ref> <ref name="Cracraft2004"> Vorlage:Literatur </ref> <ref name="Candeliere2024"> Vorlage:Cite journal </ref> <ref name="Diamond2022"> Vorlage:Cite journal Siehe insbes. Fig. 2. </ref> <ref name="Hu2020"> Wenzhe Hu, Jie Pan, Bin Wang, Jun Guo, Meng Li, Meiying Xu: Metagenomic insights into the metabolism and evolution of a new Thermoplasmata order (Candidatus Gimiplasmatales). In: Environmental Microbiology; Band 23, Nr. 7, Special Issue on Ecophysiology of Extremophiles, Juli 2021, S. 3695-3709; Vorlage:Doi, ResearchGate:347764720, Epub 9. Dezember 2020 (Vorlage:EnS). Dazu:

Study ID: Gs0140400 Genome Online Database (GOLD), Joint Genome Institute (JGI). US Department of Energy (DOE).

</ref> <ref name="Lin2015"> Vorlage:Cite journal </ref> <ref name="Moody2022"> Edmund R. R. Moody, Tara A. Mahendrarajah, Nina Dombrowski, James W. Clark, Celine Petitjean, Pierre Offre, Gergely J. Szöllősi, Anja Spang: An estimate of the deepest branches of the tree of life from ancient vertically evolving genes. In: eLife, Band 11, Nr. e66695, Epub 22. Februar 2022, Stand: 2. März 2022; Vorlage:Doi, Vorlage:PMC, PMID 35190025, PDF (Vorlage:EnS). Dazu:

Fig. 4: Phylogenie der Archaea und Bakterien, abgeekeitet aus 27 Markergenen.
- GTDB: GCA_003663645.1: EX4484-36 sp002254765, NCBI strain identifiers: B25_G2.
- GTDB: GCA_002503985.1: UBA184 sp002503985, NCBI strain identifiers: UBA61.
Edmund R. R. Moody: Protein evolution and the early history of life. Dissertation, School of Biological Sciences, University of Bristol, Februar 2022, 206 Seiten; PDF (Vorlage:EnS).
Tara A. Mahendrarajah: Tracing the evolutionary history of cellular life. Doktorarbeit, Universität Utrecht, 13. September 2024, 317 Seiten; PDF (Vorlage:EnS).

</ref> <ref name="Reysenbach2001"> Vorlage:Cite book </ref> <ref name="Rosenberg2014"> Eugene Rosenberg, Edward F. DeLong, Stephen Lory, Erko Stackebrandt, Fabiano Thompson (Hrsg.): The Prokaryotes. Other Major Lineages of Bacteria and the Archaea. In: Springer Reference, 4. Auflage, Springer-Verlag Berlin Heidelberg 2014, ISBN 978-3-642-38953-5; Vorlage:Doi (Vorlage:EnS). </ref> <ref name="Schleper1994"> Christa Schleper, G. Puehler, I. Holz, A. Gambacorta, D. Janekovic, U. Santarius, H. P. Klenk, Wolfram Zillig: Picrophilus gen. nov., fam. nov.: a Novel Aerobic, Heterotrophic, Thermoacidophilic Genus and Family Comprising Archaea Capable of Growth around pH 0. In: ASM Journals: Journal of Bacteriology, Band 177, Nr. 24, Dezember 1995, S. 7050–7059; doi:10.1128/jb.177.24.7050-7059.1995, PMID 8522509, Vorlage:PMC. </ref> <ref name="Sheridan2022"> Vorlage:Cite journal. Dazu:

Fig. 1: Phylogenomic tree of Lutacidiplasmatales and associated metabolism.
Tbl. 1: Genome characteristics of newly sequenced metagenome-assembled genomes (Ca. Lutacidiplasmatales).

</ref> <ref name="Shoemaker2024"> Vorlage:Cite journal </ref> <ref name="Su2018"> Xiaosi Su, Geng Cui, Huang Wang, Zhenxue Dai, Nam Chil Woo, Wenzhen Yuan: Biogeochemical zonation of sulfur during the discharge of groundwater to lake in desert plateau (Dakebo Lake, NW China). In: Environmental Geochemistry and Health, Band 40, Nr. 3, Juni 2018, S. 1051–1066; Vorlage:Doi, ResearchGate:316957900, PMID 28502020 (Vorlage:EnS). </ref> <ref name="Yin2022"> Xiuran Yin, Guowei Zhou, Mingwei Cai, Qing-Zeng Zhu, Tim Richter-Heitmann, David A. Aromokeye, Yang Liu, Rolf Nimzyk, Qingfei Zheng, Xiaoyu Tang, Marcus Elvert, Meng Li, Michael W. Friedrich: Catabolic protein degradation in marine sediments confined to distinct archaea. In: The ISME Journal, Band 16, Nr. 6, Juni 2022, S. 1617-1626; Vorlage:Doi, Vorlage:PMC, PMID 35220398, Epub 26. Februar 2022 (Vorlage:EnS). </ref> <ref name="Yuan2021"> Yang Yuan, Jun Liu, Tao-Tao Yang, Shao-Ming Gao, Bin Liao, Li-Nan Huang: Genomic Insights into the Ecological Role and Evolution of a Novel Thermoplasmata Order, “Candidatus Sysuiplasmatales”. In: ASM Journals: Applied and Environmental Microbiology, Band 87, Nr. 22, S. e0106521, 28. Oktober 2021; Vorlage:Doi, Vorlage:PMC, PMID 34524897, Epub 15. September 2021 (Vorlage:EnS). </ref> <ref name="Zheng2022"> Peng-Fei Zheng, Zhanfei Wei, Yingli Zhou, Qingmei Li, Zhao Qi, Xiaoping Diao, Yong Wang: Genomic Evidence for the Recycling of Complex Organic Carbon by Novel Thermoplasmatota Clades in Deep-Sea Sediments. In: ASM Journals: mSystems, Band 7, Nr. 3, 28. Juni 2022, S. e0007722; Vorlage:Doi, Vorlage:PMC, PMID 35430893, Epub 18. April 2022 (Vorlage:EnS). Siehe insbes. Tbl. 1. </ref> <ref name="Zhou2022"> Heng Zhou, Dahe Zhao, Shengjie Zhang, Qiong Xue, Manqi Zhang, Haiying Yu, Jian Zhou, Ming Li, Sumit Kumar, Hua Xiang: Metagenomic insights into the environmental adaptation and metabolism of Candidatus Haloplasmatales, one archaeal order thriving in saline lakes. In: Environmental Microbiology, Band 24, Nr. 5, Mai 2022, S. 2239-2258; Vorlage:Doi, PMID 35048500, Epub 20. Januar 2022 (Vorlage:EnS). Dazu:

ResearchGate:350172072 (Preprint).

</ref> <ref name="Zinke2021"> Laura A. Zinke, Paul N. Evans, Christian Santos-Medellin, Alena L. Schroeder, Donovan H. Parks, Ruth K. Varner, Virginia I. Rich, Gene W. Tyson, Joanne B. Emerson: Evidence for non‐methanogenic metabolisms in globally distributed archaeal clades basal to the Methanomassiliicoccales. In: Environmental Microbiology, Band 23, Nr. 1, Januar 2021, S. 340–357; Vorlage:Doi, PMID 33185945, Epub 27. November 2020 (Vorlage:EnS). Anm.: Die GTDB-Ordnung o__RBG-16-68-12 wird teilweise mit RBG-16 abgekürzt (andere GTDB-Ordnungen beginnend mit ‚o__RBG-16-…‘ sind nicht Gegenstand dieser Studie). </ref> </references>

Anmerkungen

<references group="A."> <ref name="LPSN_orphnd"> in der LPSN verwaist </ref> <ref name="A.#5"> Der vermittels Metagenomik-Daten vorgeschlagene Stamm ARK-15 gehört in der NCBI-Taxonomie zur Gattung Aciduliprofundum (Ordnung Aciduliprofundales/DHVE2). Die GTDB stellt ihn jedoch in eine eigene Ordnung ARK-15 innerhalb der (gemeinsamen) Klasse Thermoplasmata. </ref> <ref name="ist_syn"> Die Ordnungen o__PWKY01 (GTDB) und Ca. Halarchaeoplasmatales (NCBI-Taxonomie), deren Familien f__PWKY01 (GTDB) und Ca. Halarchaeoplasmataceae (NCBI), deren Gattungen PWKY01 (GTDB) und Ca. Halarchaeoplasma (NCBI), inklusive deren Spezies PWKY01 sp007133925 (GTDB) und Ca. Halarchaeoplasma halalkaliphilum (NCBI) sind jeweils synonym aufgrund des gemeinsamen Referenzstamms CSSed165cm_322 dieser Spezies. </ref> <ref name="doppelt"> Die ursprünglichen Bezeichnungen Haloplasmatales, Haloplasmataceae und Haloplasma sind wegen Doppelvergabe ungültig und wurden geändert. Haloplasmatales Vorlage:Person et al. 2008, Haloplasmataceae Vorlage:Person et al. 2008 und Haloplasma Vorlage:Person et al. 2008 bezeichnen bereits eine Bakterienordnung, -familie bzw. -gattung der Bacilli (Firmicutes, nach GTDB) oder Mollicutes (Mycoplasmatota nach LPSN, NCBI). </ref> </references>