Die morphologisch begründete (nicht-taxonomische) Gruppe der Podoviren ({{#invoke:Vorlage:lang|full|CODE=en|SCRIPTING=Latn|SERVICE=englisch}} {{#invoke:Vorlage:lang|flat}}, früher auch Morphotyp C genannt) umfasst eine Reihe von Familien, Unterfamilien und Gattungen von Viren mit einem linearen Molekül doppelsträngiger DNA (dsDNA) von 16 bis 70 kBp Länge als Genom.
Ihre Morphologie ist gekennzeichnet durch ein 50–70 nm im Durchmesser großes ikosaedrischesKapsid mit einem kurzen, nicht-kontraktilen Schwanzteil von ca. 20 × 8 nm. Je nach Gattung befinden sich am Schwanzteil sechs kurze Schwanzfibern oder mehrere kurze Fortsätze (spikes), Podoviren vom Subtyp 1 haben dagegen keine Anhängsel an Kopf und Schwanz.<ref name="Wichels1998" /> Das kurze Schwanzteil ist innerhalb der Gruppe der Prokaryoten infizierenden dsDNA-Viren mit Kopf-Schwanz-Struktur charakteristisch für die Podovirien, daher leitet sich der Name für den Morphotyp von {{#invoke:Vorlage:lang|full |CODE=el |SCRIPTING=Grek |SERVICE={{#if: {{#invoke:TemplUtl|faculty| 0 }} | neu}}griechisch |SUITABLE=prefix neu}} ab.
Die Gattungen der Podovirien unterscheiden sich hinsichtlich der Organisation des Genoms, den Mechanismen der DNA-Verpackung und dem Vorhandensein einer DNA-Polymerase. Die Spezies der Gattung Salasvirus (früher Phi29virus, Phi29likevirus, Φ29-ähnliche Viren) besitzen im Gegensatz zu den anderen ein langgestrecktes, nicht-isometrisches Kapsid. Sie wurde 2021 in die neue Familie Salasmaviridae der Caudoviricetes verschoben.
Die Gruppe galt lange Zeit als ein Virustaxon im Rang einer Virusfamilie mit der Bezeichnung Podoviridae.
Im März 2021 wurde vorgeschlagen, diese Familie mitsamt der Ordnung Caudovirales wegen fehlender Monophylie aufzulösen und (wie damals bereits z. T. geschehen) durch neu zu schaffende Familien zu ersetzen, damit neue Ergebnisse aus der Metagenomik in die Taxonomie aufgenommen werden können.<ref name="Turner2021" />
Das {{#invoke:Vorlage:lang|flat}} (ICTV) hat dem im März 2022 entsprochen.<ref name="ICTV_MSL#37" />
Gemäß Vorschlag bleibt die Bezeichnung „Podoviren“ ({{#invoke:Vorlage:lang|full|CODE=en|SCRIPTING=Latn|SERVICE=englisch}}) aber als informeller Sammelbegriff morphologisch ähnlicher Prokaryotenviren mit einem linearen Doppelstrang-DNA-Genom erhalten.<ref name="Turner2021" />
Systematik
Die folgende Systematik nach ICTV mit Stand 3./7. März 2025.<ref name="ICTV_Tax">ICTV: Taxonomy Browser.</ref><ref name="ICTV_VMR">ICTV: Virus Metadata Resource (VMR).</ref> umfasst nicht immer alle Spezies der aufgeführten Gattungen:
Nicht-taxonomische Gruppe Podoviren ({{#invoke:Vorlage:lang|full|CODE=en|SCRIPTING=Latn|SERVICE=englisch}}, auch Caudoviricetes „Morphotyp C“)
OrdnungAutographivirales (frühere FamilieAutographiviridae, zuvor Unterfamilie Autographivirinae in der damaligen Familie Podoviridae)
Ordnung Crassvirales (früher {{#invoke:Vorlage:lang|flat}}, {{#invoke:Vorlage:lang|flat}}, de crAssphagen) mit zirkulärem Genom, ursprünglich als Mitglieder der ehemaligen Familie Podoviridae vorgeschlagen. Phage crAss001 wurde kultiviert und hat Myoviren-Morphologie, ob dies für alle Mitglieder der Ordnung gilt, ist allerdings nicht gesichert.<ref name="NCBI1978007" /><ref name="SIB8496" /><ref name="Koonin2020" /><ref name="Turner2021" /><ref name="ICTV_crAssProp" /><ref name="ICTV_Shkoporov" />
Ordnung Kirjokansivirales (Archaeen-Viren mit Kopf-Schwanz-Struktur mit Podo- und Siphoviren-Morphologie, hier nur die Podoviren-Familie)<ref name="2021.001A" />
Spezies Cepunavirus Cp1 (ehem. Typus), mit Streptococcus-Phage Cp1 (ursprünglich Complutense-Phage 1 und 9)<ref>NCBI: Streptococcus virus Cp1 (species)</ref><ref name="pmid6275103">{{#invoke:Vorlage:Literatur|f}}</ref><ref name="López2004">Rubens López: Streptococcus pneumoniae and its bacteriophages: one long argument. In: International Microbiology, Band 7, Nr. 3, S. 163–171, Oktober 2004; doi:10.1093/clinids/3.2.212, ResearchGate:8223977 ({{#invoke:Vorlage:lang|full|CODE=en|SCRIPTING=Latn|SERVICE=englisch}}))</ref>
Gattung Callevirus (zirkuläres Genom, nach NCBI evtl. zu Crassvirales, siehe C. phi38una)
Spezies Callevirus Calle, mit Cellulophaga-Phage Calle<ref name="NCBI2748343" /> – Wirt: Cellulophaga sp. HaHa_2_95<ref name="NCBI2745558" /> und C. sp. HaHa_2_1,<ref name="NCBI2749994" /> Flavobacteriaceae
Spezies Callevirus phi38una, mit Cellulophaga-Phage phi38:1 und Cellulophaga-Phage phi40:1 – Wirte: Cellulophaga sp. NN016038 respektive C. sp. NN015840<ref name="NCBI1327977" />
Familie Rountreeviridae (frühere Unterfamilie Rountreevirinae der damaligen Podoviren-Familie)
{{#invoke:Vorlage:Anker|f |errCat=Wikipedia:Vorlagenfehler/Vorlage:Anker |errHide=1}}Familie Saffermanviridae – eine Familie von Cyanophagen
Einige (vom ICTV bereits offiziell registrierte) Phagen mit Podoviren-Morphotyp wie Roseobacter-Virus SIO1 (mit Phage SIO1) und Vibrio-Virus VpV262 (mit Phage VpV262) sind zwar evolutionär mit den Autographiviridae verwandt, enthalten jedoch anders als diese keine phagenkodierte RNA-Polymerase und zeigen auch größere Unterschiede auf der Ebene der Genomorganisation.<ref name="Lavigne2008" /><ref name="ICTV_MSL#35" />
Literatur
C. M. Fauquet, M. A. Mayo et al.: Eighth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. London / San Diego 2004.
David M. Knipe, Peter M. Howley et al. (Hrsg.): Fields’ Virology. 4. Auflage. Philadelphia 2001.
<references responsive>
<ref name="2021.001A">
Y. Liu et al.: Proposal 2021.001A (zip:docx) ICTV Archaeal Viruses Subcommittee. PDF via Universität Helsinki. Create three new orders and 14 new families in the class Caudoviricetes (Duplodnaviria, Uroviricota) for classification of archaeal tailed viruses. Oktober 2020. Siehe insbes. Tbl. 1.
</ref>
<ref name="ICTV_MSL#35">
ICTV Master Species List 2019.v1. ICTV. New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
</ref>
<ref name="ICTV_MSL#37">
ICTV Master Species List 2021.v1. ICTV. New MSL including all taxa updates since the 2020 release, March 2022 (MSL #37)
</ref>
<ref name="ICTV_Prop_Schito">
<templatestyles src="Webarchiv/styles.css" />{{#if:20210411050128
</ref>
<ref name="ICTV_Shkoporov">
Andrey N. Shkoporov et al.: Proposal 2021.022B. crAss-like phages Study Group. Create one new order (Crassvirales) including four new families, ten new subfamilies, 42 new genera and 73 new species (Caudoviricetes). Stand: 13. Mai 2021.
</ref>
<ref name="ICTV2020.146B">
{{#switch:
</ref>
<ref name="NCBI1327977">
Cellulophaga phage phi38:1 (species) und Cellulophaga phage phi40:1 (species). NCBI. – Zuordnung zu Crassvirales ist nicht ICTV-bestätigt
</ref>
<ref name="NCBI1978007">
NCBI Taxonomy Browser: Crassvirales (order).
</ref>
<ref name="NCBI10730">
NCBI Taxonomy Browser: Escherichia phage 933W.
</ref>
<ref name="NCBI_E34">
NCBI Taxonomy Browser: Salmonella phage 34.
</ref>
<ref name="NCBI2601254">
NCBI Taxonomy Browser: Cyanophage Ma-LEP, equivalent: Microcystis phage Ma-LEP.
</ref>
<ref name="NCBI2712957">
NCBI Taxonomy Browser: Ochrobactrum phage vB_OspP_OH.
</ref>
<ref name="NCBI2745558">
NCBI Taxonomy Browser: Cellulophaga sp. HaHa_2_95.
</ref>
<ref name="NCBI2748343">
NCBI Taxonomy Browser: Search for: pahge Calle (token set), sowie Cellulophaga phage Calle.
</ref>
<ref name="NCBI2749994">
NCBI Taxonomy Browser: Cellulophaga sp. HaHa_2_1.
</ref>
<ref name="NCBI948071">
NCBI Taxonomy Browser: Puniceispirillum phage HMO-2011.
</ref>
<ref name="ViralZone3967">
SIB: Viral exotoxin. Auf: ViralZone (expasy).
</ref>
<ref name="SIB8496">
SIB: crAss-like phages (jetzt Intestiviridae und Double Strand DNA Viruses.) Auf: ViralZone (Expasy). Order: Caudovirales
</ref>
<ref name="Brüssow2004">
Harald Brüssow, Carlos Canchaya, Wolf-Dietrich Hard: Phages and the Evolution of Bacterial Pathogens: from Genomic Rearrangements to Lysogenic Conversion. In: Microbiol Mol Biol Rev. September 2004, 68(3), S. 560–602; doi:10.1128/MMBR.68.3.560-602.2004, }} PMC 515249 (freier Volltext{{#if:|, PDF}}), PMID 15353570, siehe insbes. Tabelle 1.
</ref>
<ref name="Castillo2016">
Daniel Castillo, Mathias Middelboe: Genomic diversity of bacteriophages infecting the fish pathogen Flavobacterium psychrophilum. In: Oxford Academic: FEMS Microbiology Letters, Band 363, Nr. 24, 2. Dezember 2016, S. fnw272; {{#invoke:Vorlage:Handle|f|scheme=doi|class=plainlinks|parProblem=Problem|errCat=Wikipedia:Vorlagenfehler/Parameter:DOI|errClasses=error editoronly|errHide=1|errNS=0 4 10 100}} ({{#invoke:Vorlage:lang|full|CODE=en|SCRIPTING=Latn|SERVICE=englisch}}).
</ref>
<ref name="Decewicz2020">
Przemyslaw Decewicz, Piotr Golec, Mateusz Szymczak, Monika Radlinska, Lukasz Dziewit: Identification and Characterization of the First Virulent Phages, Including a Novel Jumbo Virus, Infecting Ochrobactrum spp. In: MDPI Int. J. Mol. Sci, 18. März 2020, Band 21, Nr. 6, Special Issue Bacteriophage – Molecular Studies, 2096; doi:10.3390/ijms21062096
</ref>
<ref name="Gipson2014">
{{#invoke:Vorlage:Literatur|f}} Corrigendum. In: Nature Communications, 12. Januar 2015, Band 6, Nr. 6040; doi:10.1038/ncomms7040.
</ref>
<ref name="Huang2015">
Sijun Huang, Si Zhang, Nianzhi Jiao, Feng Chen: Comparative Genomic and Phylogenomic Analyses Reveal a Conserved Core Genome Shared by Estuarine and Oceanic Cyanopodoviruses. In: PLOS ONE, 16. November 2015 (englisch); doi:10.1371/journal.pone.0142962
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<ref name="Kang2013">
Ilnam Kang, Hyun-Myung Oh, Dongmin Kang, Jang-Cheon Cho: Genome of a SAR116 bacteriophage shows the prevalence of this phage type in the oceans. In: PNAS, 23. Juli 2013, 110 (30), S. 12343–12348 (englisch); doi:10.1073/pnas.1219930110
</ref>
<ref name="Koonin2020">
Eugene V. Koonin, Natalya Yutin: The crAss-like Phage Group: How Metagenomics Reshaped the Human Virome. In: Trends in Microbiology, 28. Februar / 1. Mai 2020, Band 28, Nr. 5, S. 349–359 (englisch); doi:10.1016/j.tim.2020.01.010
</ref>
<ref name="Lavigne2008">
{{#invoke:Vorlage:Literatur|f}}
</ref>
<ref name="Nour2025">
Hanzada T. Nour El-Din, Maryam Kettal, José C. Granados Maciel, Greg Beaudoin, Umut Oktay, Sabahudin Hrapovic, Subash Sad, Jonathan J. Dennis, Danielle L. Peters, Wangxue Chen: Isolation, Characterization, and Genomic Analysis of Bacteriophages Against Pseudomonas aeruginosa Clinical Isolates from Early and Chronic Cystic Fibrosis Patients for Potential Phage Therapy. In: MDPI: Microorganisms, Band 13, Nr. 3, 26. Februar 2025, S. 511; {{#invoke:Vorlage:Handle|f|scheme=doi|class=plainlinks|parProblem=Problem|errCat=Wikipedia:Vorlagenfehler/Parameter:DOI|errClasses=error editoronly|errHide=1|errNS=0 4 10 100}} ({{#invoke:Vorlage:lang|full|CODE=en|SCRIPTING=Latn|SERVICE=englisch}}).
</ref>
<ref name="Oh2010">
Hyun-Myung Oh, Kae Kyoung Kwon, Ilnam Kang, Sung Gyun Kang, Jung-Hyun Lee, Sang-Jin Kim, Jang-Cheon Cho: Complete Genome Sequence of “Candidatus Puniceispirillum marinum” IMCC1322, a Representative of the SAR116 Clade in the Alphaproteobacteria. In: Journal of Bacteriology, 26. Mai 2010 (englisch); doi:10.1128/JB.00347-10, PMID 20382761.
</ref>
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Janina Rahlff, Matthias Wietz, Helge-Ansgar Giebel, Oliver Bayfield, Emelie Nilsson, Kristofer Bergström, Kristopher Kieft, Karthik Anantharaman, Mariana Ribas-Ribas, Hannah D. Schweitzer, Oliver Wurl, Matthias Hoetzinger, Alfred Antson, Karin Holmfeldt: Ecogenomics and cultivation reveal distinctive viral-bacterial communities in the surface microlayer of a Baltic Sea slick. In. Oxford Academic: ISME Communications, Band 3, Nr. 1, Dezember 2023, S. 97; doi:10.1038/s43705-023-00307-8 ({{#invoke:Vorlage:lang|full|CODE=en|SCRIPTING=Latn|SERVICE=englisch}}).
</ref>
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Ramon Sanchez-Rosario, Jesus Garcia, Vivian Rodriguez, Kevin A. Schug, Zacariah L. Hildenbrand, Ricardo A. Bernal: Using Bacteriophages to Treat Resilient Bacteria Found in Produced Water. In: MDPI Water, 7. März 2024, Band 16, Nr. 6 (englisch); doi:10.3390/w16060797. Dazu:
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Stephen Tucker, Peter Pollard: Identification of Cyanophage Ma-LBP and Infection of the Cyanobacterium Microcystis aeruginosa from an Australian Subtropical Lake by the Virus. |wayback=20210511133701 |archiv-bot=2022-12-28 15:52:53 InternetArchiveBot. In: ASM Applied and Environmental Microbiology, 3. Februar 2005, Band 71, Nr. 2, S. 629–635 (englisch); doi:10.1128/AEM.71.2.629-635.2005
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Dann Turner, Andrew M. Kropinski, Evelien M. Adriaenssens: A Roadmap for Genome-Based Phage Taxonomy. In: MDPI Viruses, 18. März 2021, Band 13, Nr. 3, Section Bacterial Viruses, 506 (englisch); doi:10.3390/v13030506
</ref>
<ref name="Villafane2008">
Robert Villafane, Milka Zayas, Eddie B. Gilcrease, Andrew M. Kropinski, Sherwood R. Casjens: Genomic analysis of bacteriophage ε34 of Salmonella enterica serovar Anatum (15+). In: BMC Microbiol., 17. Dezember 2008, 8, S. 227, (englisch); doi:10.1186/1471-2180-8-227, }} PMC 2629481 (freier Volltext{{#if:|, PDF}}), PMID 19091116.
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Antje Wichels, Stefan S. Biel, Hans R. Gelderblom, Thorsten Brinkhoff, Gerard Muyzer, Christian Schütt: Bacteriophage diversity in the North Sea. In: Applied and Environmental Microbiology, November 1998, Band 64, Nr. 11, S. 4128–4133 (englisch); doi:10.1128/AEM.64.11.4128-4133.1998, PMID 9797256, }} PMC 106618 (freier Volltext{{#if:|, PDF}}), awi.de (PDF; 0,3 MB).
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