Die morphologisch begründete (nicht-taxonomische) Gruppe der Podoviren (englisch{{Modul:Vorlage:lang}} Modul:Multilingual:153: attempt to index field 'data' (a nil value), früher auch Morphotyp C genannt) umfasst eine Reihe von Familien, Unterfamilien und Gattungen von Viren mit einem linearen Molekül doppelsträngiger DNA (dsDNA) von 16 bis 70 kBp Länge als Genom.
Ihre Morphologie ist gekennzeichnet durch ein 50–70 nm im Durchmesser großes ikosaedrischesKapsid mit einem kurzen, nicht-kontraktilen Schwanzteil von ca. 20 × 8 nm. Je nach Gattung befinden sich am Schwanzteil sechs kurze Schwanzfibern oder mehrere kurze Fortsätze (spikes), Podoviren vom Subtyp 1 haben dagegen keine Anhängsel an Kopf und Schwanz.<ref name="Wichels1998" /> Das kurze Schwanzteil ist innerhalb der Gruppe der Prokaryoten infizierenden dsDNA-Viren mit Kopf-Schwanz-Struktur charakteristisch für die Podovirien, daher leitet sich der Name für den Morphotyp von {{Modul:Vorlage:lang}} Modul:Vorlage:lang:103: attempt to index field 'wikibase' (a nil value) ab.
Die Gattungen der Podovirien unterscheiden sich hinsichtlich der Organisation des Genoms, den Mechanismen der DNA-Verpackung und dem Vorhandensein einer DNA-Polymerase. Die Spezies der Gattung Salasvirus (früher Phi29virus, Phi29likevirus, Φ29-ähnliche Viren) besitzen im Gegensatz zu den anderen ein langgestrecktes, nicht-isometrisches Kapsid. Sie wurde 2021 in die neue Familie Salasmaviridae der Caudoviricetes verschoben.
Die Gruppe galt lange Zeit als ein Virustaxon im Rang einer Virusfamilie mit der Bezeichnung Podoviridae.
Im März 2021 wurde vorgeschlagen, diese Familie mitsamt der Ordnung Caudovirales wegen fehlender Monophylie aufzulösen und (wie damals bereits z. T. geschehen) durch neu zu schaffende Familien zu ersetzen, damit neue Ergebnisse aus der Metagenomik in die Taxonomie aufgenommen werden können.<ref name="Turner2021" />
Das {{Modul:Vorlage:lang}} Modul:Multilingual:153: attempt to index field 'data' (a nil value) (ICTV) hat dem im März 2022 entsprochen.<ref name="ICTV_MSL#37" />
Gemäß Vorschlag bleibt die Bezeichnung „Podoviren“ ({{Modul:Vorlage:lang}} Modul:Vorlage:lang:103: attempt to index field 'wikibase' (a nil value)) aber als informeller Sammelbegriff morphologisch ähnlicher Prokaryotenviren mit einem linearen Doppelstrang-DNA-Genom erhalten.<ref name="Turner2021" />
Systematik
Die folgende Systematik nach ICTV mit Stand 3./7. März 2025.<ref name="ICTV_Tax">ICTV: Taxonomy Browser.</ref><ref name="ICTV_VMR">ICTV: Virus Metadata Resource (VMR).</ref> umfasst nicht immer alle Spezies der aufgeführten Gattungen:
Nicht-taxonomische Gruppe Podoviren ({{Modul:Vorlage:lang}} Modul:Vorlage:lang:103: attempt to index field 'wikibase' (a nil value), auch Caudoviricetes „Morphotyp C“)
OrdnungAutographivirales (frühere FamilieAutographiviridae, zuvor Unterfamilie Autographivirinae in der damaligen Familie Podoviridae)
Ordnung Crassvirales (früher {{Modul:Vorlage:lang}} Modul:Multilingual:153: attempt to index field 'data' (a nil value), {{Modul:Vorlage:lang}} Modul:Multilingual:153: attempt to index field 'data' (a nil value), de crAssphagen) mit zirkulärem Genom, ursprünglich als Mitglieder der ehemaligen Familie Podoviridae vorgeschlagen. Phage crAss001 wurde kultiviert und hat Myoviren-Morphologie, ob dies für alle Mitglieder der Ordnung gilt, ist allerdings nicht gesichert.<ref name="NCBI1978007" /><ref name="SIB8496" /><ref name="Koonin2020" /><ref name="Turner2021" /><ref name="ICTV_crAssProp" /><ref name="ICTV_Shkoporov" />
Ordnung Kirjokansivirales (Archaeen-Viren mit Kopf-Schwanz-Struktur mit Podo- und Siphoviren-Morphologie, hier nur die Podoviren-Familie)<ref name="2021.001A" />
Spezies Pseudomonas-Virus 119X (wiss. Jamesmcgillvirus jv119X, früher {{Modul:Vorlage:lang}} Modul:Multilingual:153: attempt to index field 'data' (a nil value))
Spezies Jamesmcgillvirus jv119X, mit Pseudomonas-Phage 119X
Spezies Jamesmcgillvirus PaMx41, mit Pseudomonas-Phage PaMx41
Spezies Cepunavirus Cp1 (ehem. Typus), mit Streptococcus-Phage Cp1 (ursprünglich Complutense-Phage 1 und 9)<ref>NCBI: Streptococcus virus Cp1 (species)</ref><ref name="pmid6275103">C. Ronda, R. López, E. García: Isolation and characterization of a new bacteriophage, Cp-1, infecting Streptococcus pneumoniae. In: J. Virol. Band40, Nr.2, 1981, S.551–559, doi:10.1128/JVI.40.2.551-559.1981, PMID 6275103, PMC 256658 (freier Volltext).</ref><ref name="López2004">Rubens López: Streptococcus pneumoniae and its bacteriophages: one long argument. In: International Microbiology, Band 7, Nr. 3, S. 163–171, Oktober 2004; doi:10.1093/clinids/3.2.212, ResearchGate:8223977 (englisch))</ref>
Spezies „{{Modul:Vorlage:lang}} Modul:Multilingual:153: attempt to index field 'data' (a nil value)“ („Streptococcus-Phage Cp-5“, Vorschlag), mit „Complutense-Phage 5“<ref>NCBI: Streptococcus phage Cp-5 (species)</ref>
Skriptfehler: Ein solches Modul „Vorlage:Anker“ ist nicht vorhanden.Familie Mktvariviridae
Skriptfehler: Ein solches Modul „Vorlage:Anker“ ist nicht vorhanden.Familie Pachyviridae<ref name="ICTV029B" />
Skriptfehler: Ein solches Modul „Vorlage:Anker“ ist nicht vorhanden.Familie Pervagoviridae<ref name="ICTV029B" />
ohne zugewiesene Unterfamilie
Gattung Callevirus (zirkuläres Genom, nach NCBI evtl. zu Crassvirales, siehe C. phi38una)
Spezies Callevirus Calle, mit Cellulophaga-Phage Calle<ref name="NCBI2748343" /> – Wirt: Cellulophaga sp. HaHa_2_95<ref name="NCBI2745558" /> und C. sp. HaHa_2_1,<ref name="NCBI2749994" /> Flavobacteriaceae
Spezies Callevirus phi38una, mit Cellulophaga-Phage phi38:1 und Cellulophaga-Phage phi40:1 – Wirte: Cellulophaga sp. NN016038 respektive C. sp. NN015840<ref name="NCBI1327977" />
Familie Rountreeviridae (frühere Unterfamilie Rountreevirinae der damaligen Podoviren-Familie)
Skriptfehler: Ein solches Modul „Vorlage:Anker“ ist nicht vorhanden.Familie Saffermanviridae – eine Familie von Cyanophagen
Spezies Traversvirus II (Escherichia-Virus Stx2 II), mit {{Modul:Vorlage:lang}} Modul:Multilingual:153: attempt to index field 'data' (a nil value)
Spezies Traversvirus min27 (Escherichia-Virus Min27), mit {{Modul:Vorlage:lang}} Modul:Multilingual:153: attempt to index field 'data' (a nil value)
Spezies Traversvirus P27 (Escherichia-Virus P27), mit {{Modul:Vorlage:lang}} Modul:Multilingual:153: attempt to index field 'data' (a nil value) alias Escherichia-Phage P27
Spezies Traversvirus PA28 (Escherichia-Virus PA28), mit {{Modul:Vorlage:lang}} Modul:Multilingual:153: attempt to index field 'data' (a nil value)
Spezies Traversvirus SH2026Stx1 (Escherichia-Virus SH2026Stx1), mit {{Modul:Vorlage:lang}} Modul:Multilingual:153: attempt to index field 'data' (a nil value)
Spezies Traversvirus ST28624 (Enterobacteria-Virus ST2-8624), mit {{Modul:Vorlage:lang}} Modul:Multilingual:153: attempt to index field 'data' (a nil value)
Spezies Traversvirus tv86 (Escherichia-Virus 86), mit {{Modul:Vorlage:lang}} Modul:Multilingual:153: attempt to index field 'data' (a nil value)
Spezies Traversvirus tv24B (Escherichia-Virus 24B), mit {{Modul:Vorlage:lang}} Modul:Multilingual:153: attempt to index field 'data' (a nil value)
Spezies Traversvirus tv933W (Escherichia-Virus 933W), mit {{Modul:Vorlage:lang}} Modul:Multilingual:153: attempt to index field 'data' (a nil value) alias Enterobacteria-Phage 933W<ref name="NCBI10730" /><ref name="ViralZone3967" />
Spezies Traversvirus WGPS9 (Escherichia-Virus WGPS9), mit {{Modul:Vorlage:lang}} Modul:Multilingual:153: attempt to index field 'data' (a nil value)
Spezies Wolominvirus OH, mit Ochrobactrum-Phage vB_OspP_OH alias vB_OspP_OH1 (englisch {{Modul:Vorlage:lang}} Modul:Multilingual:153: attempt to index field 'data' (a nil value)), ein Jumbo-Phage<ref name="NCBI2712957" /><ref name="Decewicz2020" />
Spezies „Synechococcus-Podovirus MPP-A“ (englisch „{{Modul:Vorlage:lang}} Modul:Multilingual:153: attempt to index field 'data' (a nil value)“)<ref name="Huang2015" />
Spezies „Synechococcus-Podovirus MPP-B“ (englisch „{{Modul:Vorlage:lang}} Modul:Multilingual:153: attempt to index field 'data' (a nil value)“)<ref name="Huang2015" />
Einige (vom ICTV bereits offiziell registrierte) Phagen mit Podoviren-Morphotyp wie Roseobacter-Virus SIO1 (mit Phage SIO1) und Vibrio-Virus VpV262 (mit Phage VpV262) sind zwar evolutionär mit den Autographiviridae verwandt, enthalten jedoch anders als diese keine phagenkodierte RNA-Polymerase und zeigen auch größere Unterschiede auf der Ebene der Genomorganisation.<ref name="Lavigne2008" /><ref name="ICTV_MSL#35" />
Literatur
C. M. Fauquet, M. A. Mayo et al.: Eighth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. London / San Diego 2004.
David M. Knipe, Peter M. Howley et al. (Hrsg.): Fields’ Virology. 4. Auflage. Philadelphia 2001.
</ref>
<ref name="Sandaa2008">
Ruth-Anne Sandaa et al.: Photosynthetic genes in viral populations with a large genomic size range from Norwegian coastal waters. In: FEMS Microbiology Ecology, 1. Januar 2008, Band 63, Nr. 1, S. 2–11 (englisch); doi:10.1111/j.1574-6941.2007.00400.x
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<ref name="Sharon2007">
Itai Sharon et al.: Viral photosynthetic reaction center genes and transcripts in the marine environment. In: The ISME Journal, Oktober 2007, Band 1, S. 492–501 (englisch); doi:10.1038/ismej.2007.67
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<ref name="Tucker2005">
Stephen Tucker, Peter Pollard: Identification of Cyanophage Ma-LBP and Infection of the Cyanobacterium Microcystis aeruginosa from an Australian Subtropical Lake by the Virus. |wayback=20210511133701 |archiv-bot=2022-12-28 15:52:53 InternetArchiveBot. In: ASM Applied and Environmental Microbiology, 3. Februar 2005, Band 71, Nr. 2, S. 629–635 (englisch); doi:10.1128/AEM.71.2.629-635.2005
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Dann Turner, Andrew M. Kropinski, Evelien M. Adriaenssens: A Roadmap for Genome-Based Phage Taxonomy. In: MDPI Viruses, 18. März 2021, Band 13, Nr. 3, Section Bacterial Viruses, 506 (englisch); doi:10.3390/v13030506
</ref>
<ref name="Villafane2008">
Robert Villafane, Milka Zayas, Eddie B. Gilcrease, Andrew M. Kropinski, Sherwood R. Casjens: Genomic analysis of bacteriophage ε34 of Salmonella enterica serovar Anatum (15+). In: BMC Microbiol., 17. Dezember 2008, 8, S. 227, (englisch); doi:10.1186/1471-2180-8-227, PMC 2629481 (freier Volltext), PMID 19091116.
</ref>
<ref name="Wichels1998">
Antje Wichels, Stefan S. Biel, Hans R. Gelderblom, Thorsten Brinkhoff, Gerard Muyzer, Christian Schütt: Bacteriophage diversity in the North Sea. In: Applied and Environmental Microbiology, November 1998, Band 64, Nr. 11, S. 4128–4133 (englisch); doi:10.1128/AEM.64.11.4128-4133.1998, PMID 9797256, PMC 106618 (freier Volltext), awi.de (PDF; 0,3 MB).
</ref>
</references>
